علی مطهری در مقاله ای که در هفته نامه سلیم به چاپ رسیده است،با حمایت از منتظری ادعا کرد بعد از امام (ره)با آقای منتظری خوب برخورد نشد ،عین مقاله به شرح زیر است :
شیخ حسینعلی منتظری اصفهانی و شیخ مرتضی مطهری خراسانی آنچنان با هم یکی بودند که گاهی طلاب ،منتظری را خراسانی و مطهری را اصفهانی صدا می کردند و به گفته آیت الله منتظری گاهی که نیاز مالی پیدا می کردیم دست در جیب یکدیگر می کردیم و بعداَ به هم خبر می دادیم .قبل از انقلاب،آیت الله منتظری هرگاه از زندان آزاد می شد ،مستقیماَ به منزل ما می آمد ،شاد و خندان و بدون هرگونه گله از سختی های زندان معمولاَ به ما بچه ها می گفت :چقدر انگلیسی بلدید ؟ و شروع می کرد به احوال پرسی به زبان انگلیسی. چندسال پیش در روزهای آخرحصر آیت الله منتظری به دیدن ایشان رفتم. اولین جمله ای که به من گفت ،این بود :علی دیدی با من چه کردند؟دلم فرو ریخت .گفتم:اگر شهید مطهری بود اینگونه نمی شد . سخن مرا تأیید کرد .درمجموع ما با او خوب رفتار نکردیم . امام خمینی (ره)رهبری آیت الله منتظری را به دلیل روحیات خاص ایشان صلاح نمی دانست که شاید اگر آیت الله مطهری نیز حضور داشت همین نظر را داشت ،اما امام روی جنبه فقاهت آیت الله منتظری تأکید کرده و اظهار امیدواری نموده بود که ایشان گرمی بخش حوزه علمیه دراین جهت باشد .اما ما گاهی برای تدریس ایشان هم مانع تراشیدیم و تحمل هیچ گونه اظهار نظر اجتماعی و سیاسی اورا نداشتیم و گاهی برخی روزنامه ها به ایشان توهین آشکار کردند .
خدا از سر تقصیرات همه ما بگذرد.